Akvamarin har fått navnet sitt etter de to latinske ordene aqua som betyr vann og marina som betyr havet. Steinen har i de fleste kulturer vært nært tilknyttet havet og sjøen. Romerne knyttet steinen til havguden Neptun, og grekerne hadde amuletter med akvamarin med Poseidon (Havets gud) utskjært. Egypterne, sumerene og hebraene brukte også flittig akvamarin, men her var det stort sett krigere som brukte stenen da den ga lykke og seier i kamp.